Stalni postav Zoološkog odjela datira još od sredine XIX. stoljeća (Sistematski postav/depo preparata za nastavu) uz samo djelomične prepravke i dodatke (djelomično obnovljene izložbene zbirke beskralježnjaka, te potpuno zbirke riba, a ostalo je pretrpano novijim preparatima koji se ne mogu drugdje smjestiti).

Dio fundusa je izložen u 7 prostorija: hodniku i 6 soba II. kata zgrade muzeja u Demetrovoj 1.

Hodnik:
Zbirke beskralježnjaka: puževi i školjkaši morskog dna Jadrana, razni beskralježnjaci raspoređeni po sistematskim skupinama, najpoznatiji predstavnici špiljske faune, nekoliko eksponata iz golemih zbirki egzotičnih puževa i školjkaša, te zbirke koralja tropskih mora dobivenih uglavnom od naših pomoraca

Neki eksponati:
Crveni koralj Corallum rubrum
Dubinska lignja Ommatostrephes bartami, dugačka s krakovima 1,6 m, uhvaćena u Jadranu
Jedrilac Argonauta argo
Velebitska pijavica Croatobranchus mestrovi
Golema školjkača Tridacna gigas



Soba I:
Morske ribe hrskavičnjače
Neki eksponati:
Bucanj Mola mola
Velika bijela psina Charcharodon carcharias, ulovljena u Jadranu

Soba II:
Slatkovodne i morske ribe, paklare
Neki eksponati:
Atlantska jesetra Acipenser sturio, uhvaćena 15. veljače 1939. u Neretvanskom kanalu.
Lađasta kečiga ili sim Acipenser nudiventris, uhvaćena 14. kolovoza 1946. na ušću Lonje u Savu; dugačka je bila 2 m i mase od oko 70 kg.

Soba III:
Kosturnica
Neki eksponati:
Kostur sredozemne medvjedice Monachus monachus
Kostur običnog dupina Delphinus delphis

Soba IV:
Ptice pjevice, koke, sove, papagaji, glava ulješure
Neki eksponati:
Droplja (potrk) Otis tarda
Sova kukuvija Tyto alba
Tetrijeb gluhan Tetrao urogallus









Soba V:
Ptice močvarice, morske ptice i kukci – sistematski pregled
Izbor nekih eksponata:
Tupik, Fratercula arctica, sjeverna ptica koja je prije jednog stoljeća bila stalni zimski posjetilac sjevernog Jadrana, a za koju se čak sumnjalo da se gnijezdi na buri izloženim obalama Krka i drugih kvarnerskih otoka. Primjerke je muzeju poklonio Milutin Barač iz Rijeke, koji je mnogo pridonio poznavanju ptica s područja Kvarnera
Leptiri iz roda Morpho, skupine sigurno najatraktivnijih tropskih leptira tirkizno modre preljevajuće boje krila
Leptir Danaus chrysippus, migratorna tropska vrsta koja je u posljednjih 150 godina veoma proširila svoj areal rasprostranjenja i naselila mnoge europske obale Sredozemnog mora, a od nedavno je i novi član faune Hrvatske



Soba VI:
Ptice grabljivice, egzotične ptice, sisavci Hrvatske i egzotični sisavci, preparat gorostasne psine, kostur kita perajara
Neki eksponati:
Crkavica Neophron percnopterus, regionalno izumrla vrsta, čiji se posljednji par gnijezdio u NP Paklenica na Velebitu. Nestanak ptica lešinara povezan je sa smanjivanjem obima stočarstva na hrvatskim primorskim planinama, ali i zbog krivolova, odnosno trovanja zaštićenih ptica grabljivica
Gorostasna psina Cetorhinus maximus, ženka duga 9 m uhvaćena kod Kraljevice u rujnu 1935.; ovaj bezopasni golemi morski pas koji se hrani filtrirajući plankton rijedak je, ali i stalni posjetitelj Jadranskog mora
Kostur kita perajara Balenoptera physalus, mlade ženke duge samo 11,5 m, koja je nađena nasukana kraj otoka Paga 23. siječnja 1953. godine.